La numeración de la documentación electrónica se caracteriza por ser independiente de la numeración de los documentos no electrónicos, única por tipo de CFE para toda la empresa. Cada tipo de CFE debe comenzar con el número 1 serie A y su numeración debe ser correlativa y progresiva hasta agotar siete dígitos, reiniciando nuevamente desde el número 1 con la serie siguiente, alfabética (exceptuando la letra Ñ) y de hasta dos posiciones.
El rango de números a utilizar en la documentación electrónica tiene una validez de dos años. Al vencimiento del plazo los números no utilizados deberán ser anulados e informados en el reporte diario correspondiente, no pudiendo ser reutilizados (acción realizada por eFactura).
El emisor debe ingresar en su sistema de facturación la información correspondiente a la constancia para autorización de emisión (CAE) y se deja a opción del contribuyente la forma de utilizar los rangos de numeración autorizados.